14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4113 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  100 
 
 		 226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  96.02 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  61.5 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  57.71 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  57.55 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  56.6 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  54.72 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  53.3 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  47.52 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  45.37 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  45.83 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  24.74 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  24.24 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  27.37 
 
 		 224 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>