14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1237 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  61.5 
 
 		 226 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  61.95 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  55.56 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  54.76 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  54.76 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  53.33 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  54.22 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  50.26 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  45.91 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  45.45 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  27.13 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  36.08 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  25.49 
 
 		 135 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>