23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0497 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  100 
 
 
135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  34.07 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  38.38 
 
 
224 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.207584  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.82 
 
 
325 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0673  hypothetical protein  29.37 
 
 
263 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.23 
 
 
351 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  30.3 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  30.19 
 
 
224 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.98 
 
 
234 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  28.3 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  27.36 
 
 
246 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  26.42 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.35 
 
 
279 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  30.69 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  30.69 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  24.24 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  24.24 
 
 
226 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  27.47 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.84 
 
 
258 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  25.49 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.43 
 
 
257 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>