16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1170 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  87.05 
 
 		 224 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  87.56 
 
 		 246 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  82.78 
 
 		 224 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  55.95 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  55.07 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  54.67 
 
 		 217 aa  264  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  53.12 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  50.25 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  49.3 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  48.84 
 
 		 221 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  28.3 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  21.08 
 
 		 514 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  21.69 
 
 		 516 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.43 
 
 		 279 aa  42  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>