15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002118 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00303  hypothetical protein  83.14 
 
 		 516 aa  918    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  100 
 
 		 516 aa  1080    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  54.83 
 
 		 514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2955  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 339 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3292  hypothetical protein  24.45 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0797  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000225  predicted membrane protein  31.28 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05961  hypothetical protein  30.36 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  23.41 
 
 		 221 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  23.81 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4647  hypothetical protein  32.99 
 
 		 139 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  23.41 
 
 		 221 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  26 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4755  hypothetical protein  29.27 
 
 		 144 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  25.93 
 
 		 203 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>