18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2387 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  100 
 
 		 514 aa  1066    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  54.83 
 
 		 516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00303  hypothetical protein  52.61 
 
 		 516 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2955  putative lipoprotein  43.52 
 
 		 339 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3292  hypothetical protein  24.21 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0797  hypothetical protein  31.36 
 
 		 174 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05961  hypothetical protein  35.51 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000225  predicted membrane protein  31.9 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  27.57 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  27.03 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  24.32 
 
 		 224 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4647  hypothetical protein  36.47 
 
 		 139 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  29.47 
 
 		 203 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 222 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  23.79 
 
 		 246 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  25.71 
 
 		 210 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  21.08 
 
 		 224 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  21.81 
 
 		 224 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>