20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2343 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2343  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27740  hypothetical protein  71.78 
 
 
223 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1918  transglutaminase-like enzymes putative cysteine protease-like protein  71.25 
 
 
220 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00195595  normal  0.575726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4183  hypothetical protein  65.62 
 
 
244 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3836  hypothetical protein  52.8 
 
 
231 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5260  transglutaminase-like  53.12 
 
 
234 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2856  transglutaminase domain protein  47.8 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2528  hypothetical protein  47.5 
 
 
204 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.938301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1539  transglutaminase domain-containing protein  48.41 
 
 
235 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3634  hypothetical protein  46.5 
 
 
225 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4586  hypothetical protein  44.65 
 
 
220 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3187  hypothetical protein  42.41 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3249  hypothetical protein  42.41 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3199  hypothetical protein  42.41 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1835  transglutaminase domain protein  46.15 
 
 
236 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3887  transglutaminase-like  47.02 
 
 
232 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0611971  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1465  transglutaminase-like  46.15 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.725326  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11163  hypothetical protein  36.71 
 
 
210 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2576  hypothetical protein  29.55 
 
 
244 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  31.88 
 
 
634 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>