29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3388 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  91.12 
 
 		 907 aa  1613    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  84.66 
 
 		 893 aa  1477    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  88.54 
 
 		 890 aa  1508    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  90.34 
 
 		 890 aa  1541    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  27.8 
 
 		 887 aa  272  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.16 
 
 		 875 aa  72  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  22.6 
 
 		 780 aa  67.8  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  19.98 
 
 		 949 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  21.94 
 
 		 852 aa  62  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  22.11 
 
 		 945 aa  60.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  21.46 
 
 		 893 aa  55.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  22.72 
 
 		 770 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  21.83 
 
 		 944 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  23.6 
 
 		 856 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  20.51 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  21.46 
 
 		 944 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  22.29 
 
 		 944 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 925 aa  51.2  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3113  hypothetical protein  25.25 
 
 		 996 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  23.11 
 
 		 996 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  25.66 
 
 		 996 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2245  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  48.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  25.83 
 
 		 996 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  22.35 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3616  hypothetical protein  26.16 
 
 		 996 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  22.18 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2612  hypothetical protein  26.16 
 
 		 996 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0746297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1007 aa  44.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>