28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0307 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  95.65 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  86.96 
 
 		 138 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  72.18 
 
 		 133 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  38.93 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  36.64 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  34.13 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  32.38 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  27.97 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  29.7 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  31 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  28.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  28.1 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3742  hypothetical protein  24 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  27.41 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  27.41 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27.41 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  27.27 
 
 		 131 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  27.27 
 
 		 131 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  27.27 
 
 		 131 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  26.72 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>