More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0213 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  96.86 
 
 
318 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
318 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.48 
 
 
318 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.71 
 
 
318 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  83.33 
 
 
318 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.36 
 
 
318 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  77.36 
 
 
318 aa  534  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.34 
 
 
317 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  64.47 
 
 
318 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  63.92 
 
 
319 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  63.18 
 
 
297 aa  394  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  44.38 
 
 
313 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  46.23 
 
 
313 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  41.8 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  42.99 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  37.83 
 
 
323 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  40.79 
 
 
304 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  38.28 
 
 
308 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  36.94 
 
 
318 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
304 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.41 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
638 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.46 
 
 
306 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  38.21 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.38 
 
 
309 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
310 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.87 
 
 
331 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.98 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.06 
 
 
308 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
320 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
320 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 
320 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  38.21 
 
 
310 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  35.9 
 
 
555 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
407 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  35.86 
 
 
312 aa  192  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
326 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
333 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
333 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
333 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.09 
 
 
335 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  35.76 
 
 
311 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
312 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.88 
 
 
302 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  36.22 
 
 
316 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  37.09 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  39.03 
 
 
325 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.55 
 
 
330 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  35.42 
 
 
320 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.33 
 
 
311 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.33 
 
 
311 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  36.77 
 
 
311 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  36.54 
 
 
323 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 
427 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.06 
 
 
340 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  35.5 
 
 
330 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  34.6 
 
 
318 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
325 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  35.85 
 
 
320 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  35.6 
 
 
319 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  34.59 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  38.16 
 
 
325 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35.58 
 
 
310 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.34 
 
 
318 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  36.3 
 
 
310 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  35.62 
 
 
310 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  36.07 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  36.57 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  36.57 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  34.28 
 
 
320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  34.28 
 
 
320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  34.28 
 
 
320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
348 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  34.28 
 
 
320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  35.29 
 
 
308 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  36.77 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  34.52 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  35.03 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  35.76 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  36.27 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
315 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  33.87 
 
 
340 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  36.01 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  35.03 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  36.08 
 
 
453 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  34.2 
 
 
396 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  34.71 
 
 
319 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.5 
 
 
306 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  35.48 
 
 
318 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  36.45 
 
 
311 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  34.94 
 
 
321 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  36.3 
 
 
311 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
321 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>