169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0032 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  100 
 
 
341 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  97.07 
 
 
347 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  52.33 
 
 
353 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  51.03 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  48.97 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  47.8 
 
 
344 aa  334  1e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  48.25 
 
 
344 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  48.54 
 
 
344 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  44.77 
 
 
345 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  46.51 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  38.44 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  36.57 
 
 
351 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  34.29 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  34.29 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  34.4 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  35.47 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  33.43 
 
 
353 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.54 
 
 
334 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  32.37 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  32.44 
 
 
327 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  32.44 
 
 
309 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  31.56 
 
 
327 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  28.99 
 
 
320 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  28.23 
 
 
326 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  29.09 
 
 
326 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  29.14 
 
 
316 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  30.23 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  28.35 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  28.86 
 
 
338 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  29.94 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  28.53 
 
 
336 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  30.59 
 
 
322 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  29.04 
 
 
436 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  27.11 
 
 
343 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  28.57 
 
 
320 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  31.58 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  26.71 
 
 
321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  28.87 
 
 
321 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  28.06 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  28.26 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  29.5 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  29.5 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  26.81 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  29.5 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  28.19 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  29.5 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  29.5 
 
 
321 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  28.06 
 
 
323 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  29.2 
 
 
321 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  28.06 
 
 
323 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  27.79 
 
 
322 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  28.06 
 
 
323 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  27.3 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  29.91 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  25.83 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  28.45 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  26.8 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  25.37 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  24.85 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  25 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  24.85 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  27.59 
 
 
335 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  27.46 
 
 
322 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  27.63 
 
 
321 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  26.73 
 
 
335 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  24.56 
 
 
342 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  28.53 
 
 
341 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  27.19 
 
 
317 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
641 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  29.03 
 
 
339 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  27.83 
 
 
323 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  25.62 
 
 
325 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.53 
 
 
641 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.53 
 
 
641 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  29.32 
 
 
330 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
620 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
620 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.53 
 
 
641 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.53 
 
 
641 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
620 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  23.94 
 
 
323 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  27.35 
 
 
320 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  28.74 
 
 
321 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  26.74 
 
 
367 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1625  glucokinase  26.46 
 
 
322 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
642 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
642 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
642 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
642 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
642 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  26.98 
 
 
324 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
642 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>