More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75487 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  100 
 
 
323 aa  667    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  63.88 
 
 
325 aa  381  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03313  dimethyladenosine transferase (AFU_orthologue; AFUA_7G04860)  63.6 
 
 
403 aa  349  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.816123 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  56.12 
 
 
320 aa  338  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19122  predicted protein  51.38 
 
 
322 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  39.82 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  36.62 
 
 
249 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  38.16 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1958  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.331165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  36.24 
 
 
266 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3029  dimethyladenosine transferase  37.14 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  38.39 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1571  dimethyladenosine transferase  39.35 
 
 
258 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0280695 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 
275 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
263 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  35.37 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  33.18 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2392  dimethyladenosine transferase  39.3 
 
 
284 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  36.61 
 
 
263 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2671  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
290 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1094  dimethyladenosine transferase  34.89 
 
 
281 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  32.87 
 
 
260 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0621  dimethyladenosine transferase  34.73 
 
 
292 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 
263 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0550  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 
262 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.659691  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  35.62 
 
 
263 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  35.81 
 
 
262 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  33.48 
 
 
262 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  37.56 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  31.05 
 
 
298 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  33.2 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1871  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  33.77 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  33.77 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  34.56 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  35.19 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  32.79 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  33.03 
 
 
263 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  32.27 
 
 
292 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  30.86 
 
 
292 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  32.79 
 
 
279 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  33.63 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.84 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  37.38 
 
 
227 aa  112  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36.41 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  35 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.36 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  36.6 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  30.09 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
272 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  35.44 
 
 
291 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  34.75 
 
 
276 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  34.6 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  33.49 
 
 
261 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  34.84 
 
 
276 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1382  dimethyladenosine transferase  34.78 
 
 
228 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.462909  normal  0.033279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  34.27 
 
 
287 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  30.32 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  32.3 
 
 
275 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1104  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 
230 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 
285 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1084  dimethyladenosine transferase  28.1 
 
 
314 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  28.34 
 
 
291 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  31.4 
 
 
285 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  31.4 
 
 
285 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  29.55 
 
 
291 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 
284 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
277 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  30.83 
 
 
288 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  28.62 
 
 
290 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  31.22 
 
 
291 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  32 
 
 
276 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  29.58 
 
 
297 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  30.16 
 
 
302 aa  106  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  29.58 
 
 
297 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  32.48 
 
 
269 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2104  dimethyladenosine transferase  31.84 
 
 
303 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.097834  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  29.96 
 
 
268 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  33.19 
 
 
271 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  34.82 
 
 
258 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  32.14 
 
 
266 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  32.39 
 
 
268 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  30.33 
 
 
284 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  31.53 
 
 
258 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0404  dimethyladenosine transferase  35.75 
 
 
235 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.651839 
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  30.28 
 
 
291 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  30.29 
 
 
285 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  31.37 
 
 
278 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>