74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71233 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_71233  predicted protein  100 
 
 
344 aa  712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.532537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02190  actin binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07150)  49.29 
 
 
447 aa  282  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02050  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, putative  44.41 
 
 
365 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306022  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50535  predicted protein  38.43 
 
 
273 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0888954  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33853  predicted protein  29.17 
 
 
311 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7292  predicted protein  34.3 
 
 
203 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022094  normal  0.0611989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  28.95 
 
 
191 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  30.06 
 
 
221 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
215 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  29.85 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  29.17 
 
 
355 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  28.1 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  28.1 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  28.1 
 
 
290 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.33 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  25 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  26.32 
 
 
205 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
250 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
204 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  29.17 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  28.35 
 
 
524 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  28.86 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
854 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
208 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  25 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  24.66 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  24.66 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.33 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  27.2 
 
 
449 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  24.66 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
204 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.05 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  22.96 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  23.23 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.66 
 
 
250 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2414  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.106748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  22.31 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  22.78 
 
 
209 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  24.66 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.19 
 
 
277 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  26.45 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
244 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  23.23 
 
 
209 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  25 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  23.23 
 
 
209 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  23.58 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>