60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45794 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  38.06 
 
 
302 aa  188  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  73.56 
 
 
516 aa  145  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  37.5 
 
 
210 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  41.59 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  38.18 
 
 
212 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  35.06 
 
 
205 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  34.68 
 
 
233 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  33.91 
 
 
207 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  35.43 
 
 
230 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.32 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  25.97 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  31 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  25.43 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  24.57 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  25.63 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  24.68 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  24.57 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  25.54 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  26.91 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  26.72 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  29.13 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  27.88 
 
 
200 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  25.64 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  26.79 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  23.5 
 
 
204 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  24.02 
 
 
192 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  24.37 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  24.58 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  40 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  23.73 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  23.58 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  23.73 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  23.14 
 
 
185 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  24.46 
 
 
191 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  36.11 
 
 
184 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  24.89 
 
 
197 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  22.22 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  24.02 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  34.25 
 
 
186 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  24.58 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  30.14 
 
 
190 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  23.46 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  23.04 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  23.05 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  33.75 
 
 
102 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  23.95 
 
 
204 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  21.72 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.87 
 
 
189 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  30.38 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.89 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  34.72 
 
 
197 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  23.42 
 
 
196 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  25.11 
 
 
189 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>