119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41230 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41230  predicted protein  100 
 
 		 108 aa  223  8e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.255013 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  30.48 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.55 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  29.55 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.27 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.11 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  29.36 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.3 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3850  hypothetical protein  30.84 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  26.21 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2456  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.74 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.198045  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2604  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.23 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  27.62 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.53 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1286  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.792681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  28.85 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  22.64 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3630  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.26 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  29.89 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  26.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.85 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.56 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  43.75 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.61 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  26.04 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.28 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.41 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.1 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.57 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.91 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.3 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  28.85 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.31 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.84 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.27 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.16 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0373  hypothetical protein  26.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  24.18 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.41 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.76 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  26.14 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.67 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2041  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.26 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000392642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.29 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.371874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  25.49 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.85 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.57 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  26.14 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4052  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.24 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.78 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46941 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08497  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01340)  28.89 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.696938 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  20.19 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  22.94 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2892  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.53 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.19 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4010  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.24 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1429  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.59 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2065  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  23.76 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1172  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.94 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43250  hypothetical protein  25.26 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.708764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  24.51 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.53 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3564  hypothetical protein  23.53 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.93 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.3 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06105  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.015615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1406  hypothetical protein  23.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.06 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.76 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  26.14 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.59 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.27 
 
 		 130 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.46 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.72 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  24.53 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5105  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2597  hypothetical protein  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.76 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1360  hypothetical protein  24.53 
 
 		 164 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7165  hypothetical protein  27.96 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1801  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  hitchhiker  0.00074845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.16 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.69 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0697  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.18 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.61 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.49 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2699  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.66 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  23.3 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.59 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.51 
 
 		 131 aa  40.8  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.44 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>