More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34307 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34307  Ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
323 aa  661    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362239  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01965  phosphoribosyl diphosphate synthase isoform 4 (AFU_orthologue; AFUA_4G10790)  68.57 
 
 
320 aa  449  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65580  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.62 
 
 
320 aa  441  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0342194  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02440  ribose-phosphate diphosphokinase, putative  61.25 
 
 
328 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00330  conserved hypothetical protein  50.14 
 
 
357 aa  332  6e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
314 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.39 
 
 
317 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.33 
 
 
314 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  47.28 
 
 
312 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.3 
 
 
312 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.39 
 
 
317 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.08 
 
 
331 aa  291  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 
314 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.98 
 
 
318 aa  288  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.51 
 
 
317 aa  288  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.02 
 
 
312 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  45.83 
 
 
313 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
317 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.4 
 
 
316 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
309 aa  286  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.6 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.41 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
318 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.85 
 
 
315 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.9 
 
 
327 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.14 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.3 
 
 
313 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
315 aa  280  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 
316 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.68 
 
 
315 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.73 
 
 
317 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.55 
 
 
310 aa  278  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
316 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.13 
 
 
321 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.89 
 
 
319 aa  278  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
316 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.4 
 
 
316 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.13 
 
 
321 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.13 
 
 
321 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
319 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.23 
 
 
328 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
309 aa  277  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
313 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.44 
 
 
342 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.23 
 
 
310 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.71 
 
 
316 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.27 
 
 
322 aa  275  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0575408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.56 
 
 
339 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.22 
 
 
326 aa  275  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.9 
 
 
316 aa  275  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.45 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.99 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.84 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.45 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.25 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.45 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000456755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.87 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.87 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
314 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.9 
 
 
315 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.53 
 
 
325 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.22 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.04 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.99 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.22 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  42.55 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
309 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
316 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.36 
 
 
317 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.34 
 
 
309 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
316 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
319 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
310 aa  272  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.63 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.41 
 
 
313 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.97 
 
 
311 aa  271  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.83 
 
 
310 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.99 
 
 
315 aa  271  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>