More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6277 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_6277  predicted protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.419157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3209  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.228395  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  32.04 
 
 		 191 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  35.03 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  33.52 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  39.07 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  38.16 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  38.16 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  32.6 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  33.14 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  35.76 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  34.71 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  37.41 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  28.02 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79930  predicted protein  29.21 
 
 		 223 aa  90.1  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.529779  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  31.87 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  34.16 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  34.07 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  30.81 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  35.26 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  34.42 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  28.18 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  28.18 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  35.23 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  35.33 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  32.37 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  29.38 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  35.1 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  35.53 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4132  hypothetical protein  36.99 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  34.67 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  34.42 
 
 		 235 aa  85.9  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  36.42 
 
 		 193 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  35.1 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  31.64 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3840  hypothetical protein  31.87 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.054425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  33.53 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  36.69 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  30.9 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  33.12 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  32.5 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  32.45 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  32.6 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  31.55 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  31.87 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  33.55 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  35.53 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0104  hypothetical protein  30.29 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3750  hypothetical protein  33.56 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226065  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  32.94 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0876  hypothetical protein  32.42 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  32 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  32.3 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  29.53 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  32.79 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  27.12 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  29.53 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1174  hypothetical protein  33.55 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  31.06 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  29.61 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1620  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.07 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.215928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  35.19 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  35.19 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6854  hypothetical protein  34.34 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0909873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3627  hypothetical protein  29.44 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  28.09 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  31.84 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  31.1 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  30.13 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  36.71 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.54 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  31.03 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  31.07 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  28.41 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  32.57 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.831461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>