24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50238 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50238  predicted protein  100 
 
 
625 aa  1312    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56509  predicted protein  42.05 
 
 
669 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48300  predicted protein  34.42 
 
 
746 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0439212  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65263  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  29.54 
 
 
653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75745  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  30.79 
 
 
695 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
588 aa  157  6e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63619  Beta-glucan synthesis-associated protein  28.41 
 
 
482 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10779  putative 1,6-beta-glucan synthetase (Eurofung)  27.19 
 
 
632 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
599 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00550  glucosidase, putative  29.44 
 
 
619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00380  glucosidase, putative  26.33 
 
 
623 aa  141  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00410  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  27.46 
 
 
622 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01640  glucosidase, putative  28.46 
 
 
834 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  35.48 
 
 
409 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.62 
 
 
1290 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.37 
 
 
281 aa  50.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  33.83 
 
 
274 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 
641 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.36 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  25.85 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 
608 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  30.58 
 
 
588 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  29.2 
 
 
276 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>