29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47888 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  100 
 
 		 854 aa  1682    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47701  predicted protein  27.72 
 
 		 795 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  37.1 
 
 		 1000 aa  115  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  28.49 
 
 		 755 aa  84.3  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  45.45 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  38.26 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46405  predicted protein  39.78 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.03 
 
 		 2313 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  31.94 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  34.43 
 
 		 1461 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  39.32 
 
 		 467 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  43.08 
 
 		 398 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  33.56 
 
 		 504 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0989  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.43 
 
 		 3685 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  23.87 
 
 		 926 aa  51.2  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47562  predicted protein  31.71 
 
 		 541 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  35 
 
 		 136 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  21.79 
 
 		 630 aa  48.5  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  39.5 
 
 		 479 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  24.4 
 
 		 840 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  37.86 
 
 		 1567 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  27.52 
 
 		 489 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  36.29 
 
 		 744 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11401  predicted protein  41.96 
 
 		 116 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121452  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  38.93 
 
 		 735 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40917  predicted protein  34.82 
 
 		 180 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.251783  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  29.46 
 
 		 555 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>