21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45954 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  100 
 
 
1041 aa  2146    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  52.94 
 
 
1858 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  48.98 
 
 
837 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  49.12 
 
 
1474 aa  64.7  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  48.98 
 
 
518 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  51.11 
 
 
419 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  40 
 
 
841 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  45.28 
 
 
705 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  45.28 
 
 
844 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  40 
 
 
1717 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  41.51 
 
 
940 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  40 
 
 
462 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
651 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  38.3 
 
 
1544 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  38.3 
 
 
1544 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_006686  CND05720  conserved hypothetical protein  44 
 
 
290 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.581789  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45987  predicted protein  35.29 
 
 
2344 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48135  predicted protein  40.91 
 
 
840 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525832  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  36.21 
 
 
784 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  29.55 
 
 
2413 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  44.68 
 
 
444 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.143202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>