27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45400 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  100 
 
 
342 aa  706    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  39.08 
 
 
317 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  37.24 
 
 
309 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.1 
 
 
284 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  30.33 
 
 
914 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  40 
 
 
86 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  37.35 
 
 
84 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  38.75 
 
 
105 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  33.02 
 
 
114 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  37.5 
 
 
84 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  33.72 
 
 
130 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  34.15 
 
 
86 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  31.13 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  29.7 
 
 
122 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  36.25 
 
 
85 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  28.16 
 
 
118 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  32.14 
 
 
94 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  29.76 
 
 
118 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  33.33 
 
 
87 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  32.43 
 
 
78 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  29.25 
 
 
123 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  29.11 
 
 
86 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  28.85 
 
 
130 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  30.49 
 
 
130 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  28.57 
 
 
118 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  28.57 
 
 
118 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  35.44 
 
 
118 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>