More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26256 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
526 aa  1085    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19549  predicted protein  55.07 
 
 
428 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.277088 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04750  adenylosuccinate synthase, putative  53.68 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154045  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  52.93 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  46.39 
 
 
428 aa  403  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00893  Adenylosuccinate synthetase (EC 6.3.4.4) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1T5]  47.65 
 
 
424 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 
424 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
428 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 
427 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 
433 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  47.54 
 
 
433 aa  385  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  46.89 
 
 
429 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.72 
 
 
430 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  46.76 
 
 
430 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 
428 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
428 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 
424 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  44.89 
 
 
426 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 
427 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 
444 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  44.92 
 
 
423 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 
428 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
427 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 
425 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  46.65 
 
 
430 aa  368  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
434 aa  365  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 
429 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 
423 aa  364  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  45.13 
 
 
430 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
429 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 
423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 
432 aa  362  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 
438 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
438 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  45.05 
 
 
432 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  44.36 
 
 
427 aa  360  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 
431 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  44.66 
 
 
430 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  43.26 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 
434 aa  356  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  42.59 
 
 
427 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  41.61 
 
 
434 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  44.6 
 
 
430 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 
426 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 
428 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 
428 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  41.31 
 
 
423 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  44.37 
 
 
428 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  40.91 
 
 
434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  42.5 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
432 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
432 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
426 aa  353  4e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 
432 aa  353  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 
429 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
432 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 
427 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  44.31 
 
 
432 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  42.32 
 
 
434 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  43.47 
 
 
429 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  43.47 
 
 
427 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 
432 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 
418 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  44.65 
 
 
432 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
428 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  44.16 
 
 
428 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  42.18 
 
 
431 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 
430 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  42.28 
 
 
428 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 
432 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
429 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
429 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
429 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
429 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  44.68 
 
 
416 aa  350  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  44.08 
 
 
426 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 
429 aa  349  6e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3162  adenylosuccinate synthetase  42.73 
 
 
458 aa  349  7e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  45.8 
 
 
429 aa  349  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  44.52 
 
 
437 aa  349  8e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 
416 aa  349  9e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 
416 aa  349  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 
416 aa  349  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
432 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  44.08 
 
 
431 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  43.13 
 
 
427 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 
427 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  44.79 
 
 
432 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  45 
 
 
807 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  42.76 
 
 
431 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  45.56 
 
 
429 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  44.66 
 
 
427 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 
432 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 
445 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 
427 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  44.1 
 
 
431 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>