More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15019 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_15019  predicted protein  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27615  predicted protein  43.33 
 
 
318 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.572712  decreased coverage  0.00312462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  36.32 
 
 
242 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.9 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.1 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.1 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.93 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.63 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.45 
 
 
248 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  33.49 
 
 
245 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  32.55 
 
 
250 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.21 
 
 
246 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.1 
 
 
245 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.97 
 
 
246 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  33.17 
 
 
248 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  34.45 
 
 
244 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.97 
 
 
246 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.66 
 
 
315 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.97 
 
 
246 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.19 
 
 
253 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.13 
 
 
250 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  31.25 
 
 
247 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.13 
 
 
246 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  31.71 
 
 
251 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.12 
 
 
246 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.87 
 
 
256 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.9 
 
 
247 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.65 
 
 
247 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.13 
 
 
316 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  35.79 
 
 
250 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  32.85 
 
 
245 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  33.95 
 
 
256 aa  101  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  33.49 
 
 
263 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00084  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.17 
 
 
247 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.9 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002269  23S rRNA (guanosine-2'-O-) -methyltransferase RlmB  33.17 
 
 
248 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  30.77 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  29.67 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  33.65 
 
 
248 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.71 
 
 
246 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.17 
 
 
256 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  33.18 
 
 
248 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.26 
 
 
255 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.85 
 
 
251 aa  98.6  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.99 
 
 
247 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.67 
 
 
256 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2232  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.13 
 
 
256 aa  98.2  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.67 
 
 
256 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  33.5 
 
 
250 aa  98.2  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.92 
 
 
264 aa  97.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  33.97 
 
 
234 aa  97.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.66 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.11 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  27.88 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  31.96 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  31.22 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  27.88 
 
 
289 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.97 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  30.62 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0683  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.24 
 
 
255 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.427045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  33.5 
 
 
261 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.73 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.68 
 
 
237 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  36.94 
 
 
255 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.98 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.98 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.98 
 
 
246 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.99 
 
 
256 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.18 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  33.94 
 
 
248 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.97 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.8 
 
 
363 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.96 
 
 
246 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0581  RNA methyltransferase  33.49 
 
 
246 aa  94.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61599  hitchhiker  0.0000000000000171085 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  35 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.5 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  35 
 
 
270 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.96 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.66 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0658  RNA methyltransferase  33.81 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36 
 
 
248 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  31.73 
 
 
314 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.55 
 
 
267 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  32.69 
 
 
314 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.46 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  33 
 
 
249 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.49 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.42 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.49 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  32.8 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  33.17 
 
 
373 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  33.17 
 
 
372 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.11 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.49 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>