77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0659 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  42.46 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  39.68 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  38.74 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  38.31 
 
 
256 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  38.26 
 
 
266 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  32.32 
 
 
257 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  35.21 
 
 
267 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  36.36 
 
 
259 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.75 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.06 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.39 
 
 
290 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  25.19 
 
 
285 aa  89  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.46 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  31.92 
 
 
289 aa  79  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.72 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.2 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.14 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.17 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  28.41 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.16 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  28.36 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.99 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  20.45 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.57 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.19 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  22.87 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  23.17 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  23.17 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  28.27 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  31.25 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  29.41 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.32 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  26.04 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  26.04 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  28.52 
 
 
319 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.41 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  23.08 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.04 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.92 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  25.48 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.15 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.31 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  26.13 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.31 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  26.13 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.78 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  22.31 
 
 
297 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  26.72 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  23.53 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  25.48 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.11 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  24.23 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  27.32 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  24.43 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  26.25 
 
 
311 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  25.31 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  27.94 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  27.38 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  22.31 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  24.21 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  26.56 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  22.48 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  22.09 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  26.85 
 
 
618 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  25.63 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  25.1 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  27.6 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  23.14 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  24.79 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  29.44 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  28.64 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  24.7 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>