More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0258 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  75.81 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  74.09 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  72.87 
 
 		 253 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  72.87 
 
 		 250 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  72.06 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  70.97 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  68.7 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  69.35 
 
 		 254 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  68.98 
 
 		 246 aa  352  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  66.27 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 262 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  65.46 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  64.23 
 
 		 250 aa  338  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  67.62 
 
 		 253 aa  337  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  64.37 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  65.73 
 
 		 280 aa  334  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  63.01 
 
 		 250 aa  333  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  65.18 
 
 		 261 aa  333  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  65.32 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  65.32 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  64.52 
 
 		 254 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 249 aa  331  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  62.9 
 
 		 261 aa  330  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  66.94 
 
 		 247 aa  331  9e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  65.85 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  64.11 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  66.12 
 
 		 254 aa  328  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  61.75 
 
 		 257 aa  328  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  65.18 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  65.2 
 
 		 261 aa  325  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  63.93 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  63.93 
 
 		 244 aa  325  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  62.95 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2281  FeS assembly ATPase SufC  61.29 
 
 		 262 aa  321  6e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3074  FeS assembly ATPase SufC  62.65 
 
 		 259 aa  321  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0960  FeS assembly ATPase SufC  59.76 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  63.82 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 257 aa  318  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0708  FeS assembly ATPase SufC  62.45 
 
 		 260 aa  317  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  59.27 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2923  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.843618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  60.87 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  64.08 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0405  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.300963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  62.9 
 
 		 249 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  62.86 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  62.35 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  61.81 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  64.46 
 
 		 248 aa  314  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 261 aa  314  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 		 256 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0115  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4851  ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4692  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4707  iron regulated ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5217  ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5088  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  64.23 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5125  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  60.08 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4805  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.874646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3579  FeS assembly ATPase SufC  58.47 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0843  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0859  FeS assembly ATPase SufC  58.87 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00902291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5123  FeS assembly ATPase SufC  58.06 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5120  ABC transporter, ATP-binding protein  58.06 
 
 		 261 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.06 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  58.06 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  59.2 
 
 		 263 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  60.56 
 
 		 273 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  59.92 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  59.6 
 
 		 261 aa  309  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  58.8 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  61.13 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  61.94 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  62.66 
 
 		 250 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  59.43 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  60.4 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  56.4 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  62.18 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 		 252 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  59.11 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  59.11 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1507  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274467  normal  0.26759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  59.11 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  59.11 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0697  FeS assembly ATPase SufC  59.02 
 
 		 262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.85326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2448  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0483537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  59.26 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  59.11 
 
 		 248 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>