33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0703 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  99.75 
 
 
399 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  811    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  28.64 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  26.28 
 
 
378 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  25.43 
 
 
356 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  27.32 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  26.67 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  34.32 
 
 
350 aa  93.2  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  26.5 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  22.81 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  36.72 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  24.86 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  32.5 
 
 
366 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  37.1 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  36.59 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  36.59 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  34.62 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  28.18 
 
 
391 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  47.62 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.38 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  47.83 
 
 
558 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  21.01 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0439  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
553 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  34.04 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  37.7 
 
 
247 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  32.5 
 
 
275 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  36.21 
 
 
343 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  37.5 
 
 
573 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  32.65 
 
 
349 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  36 
 
 
906 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  30.51 
 
 
323 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  35.48 
 
 
543 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>