34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0566 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  98.91 
 
 		 552 aa  1124    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1135    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  43.26 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  36.73 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  38.36 
 
 		 290 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  38.3 
 
 		 195 aa  97.8  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  36.36 
 
 		 942 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  32.39 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  29.27 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  28.87 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  25.83 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  29.93 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  33.91 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  26.09 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  30 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  22.22 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  30.77 
 
 		 245 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  23.28 
 
 		 268 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  23.91 
 
 		 298 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  29.59 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  27.74 
 
 		 584 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  24.77 
 
 		 300 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  21.54 
 
 		 298 aa  50.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  25.31 
 
 		 462 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  23.47 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.82 
 
 		 1266 aa  47.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  23.6 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  34.33 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  39.39 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  21.9 
 
 		 135 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  25.11 
 
 		 301 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>