13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3600 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  944    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  34.75 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  25.31 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  37.14 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  25.81 
 
 		 552 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  31.31 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  29.7 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.89 
 
 		 1348 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  27.46 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.85 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  33.75 
 
 		 283 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  33.75 
 
 		 283 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 		 1373 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>