23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4467 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  100 
 
 		 319 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  78.06 
 
 		 319 aa  524  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  63.61 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  59.43 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  55.56 
 
 		 325 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  47.06 
 
 		 173 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  51.03 
 
 		 165 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  51.03 
 
 		 165 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  50.61 
 
 		 165 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  45.31 
 
 		 132 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  45.31 
 
 		 132 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  41.06 
 
 		 157 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  38.82 
 
 		 160 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  41.55 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  39.57 
 
 		 137 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  40.62 
 
 		 138 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  40.14 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  42.97 
 
 		 139 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  40.44 
 
 		 163 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  29.01 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  23.91 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2052  hypothetical protein  28.67 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>