23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1745 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  100 
 
 
404 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  35.8 
 
 
339 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  29.12 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  31.25 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  34.62 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  33.33 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  29.49 
 
 
630 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  35.42 
 
 
179 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  29.61 
 
 
727 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  31.18 
 
 
179 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  22.16 
 
 
176 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  32.69 
 
 
747 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  30.77 
 
 
179 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  29.35 
 
 
179 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  32.71 
 
 
189 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  33.64 
 
 
174 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  33.66 
 
 
676 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  33.33 
 
 
949 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  27.85 
 
 
175 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  24.18 
 
 
696 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1873  Phage tail protein  31.52 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0677099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3833  phage tail protein  30.43 
 
 
524 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.332604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>