46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2703 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25.73 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  25.83 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  26.86 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  26.82 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  26.92 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.69 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  25.41 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  24.9 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  24.07 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  25.7 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  25.37 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  25.62 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  26.04 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  23.83 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  22.54 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  31.13 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  25.93 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  24.5 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  24.3 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  21.74 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  24.36 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  28.41 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  27 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.84 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  28.41 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  26.72 
 
 		 278 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  22.3 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  22.73 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  23.88 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28.41 
 
 		 864 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  27.09 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  22.31 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  22.31 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  22.31 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  23.86 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  35.71 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  23.86 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  27 
 
 		 289 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  23.86 
 
 		 292 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  27.27 
 
 		 378 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>