49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68480  chorismate mutase  100 
 
 		 185 aa  354  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.188897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5928  chorismate mutase  89.67 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  41.14 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03115  chorismate mutase  41.01 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  40.12 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  41.77 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0422  chorismate mutase  35.84 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04710  chorismate mutase  38.51 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  35.84 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3783  chorismate mutase  36.36 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4860  chorismate mutase  36.36 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.89966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  35.03 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  33.75 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  33.51 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  32.97 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  32.1 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  30.29 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7813  chorismate mutase  35.33 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  32.95 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  30.06 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  30.06 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4921  chorismate mutase, putative  33.13 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  28.21 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  33.52 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  33.52 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  34.39 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  31.41 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  31.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  31.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  31.41 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  31.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  31.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  30.77 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5910  chorismate mutase  34.97 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  33.76 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5080  chorismate mutase  27.74 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  31.48 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5099  chorismate mutase  34.36 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  31.15 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  31.15 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  31.15 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2767  chorismate mutase  28.99 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209555  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  33.58 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  33.33 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  37.78 
 
 		 399 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  28.57 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  37.14 
 
 		 391 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  30.83 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1764  chorismate mutase  32.29 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>