18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  84.95 
 
 
184 aa  243  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  70.74 
 
 
184 aa  234  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  58.51 
 
 
183 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  57.45 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  40.54 
 
 
172 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  35.38 
 
 
202 aa  87.8  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  35.33 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  38.98 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  38.14 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  43.94 
 
 
318 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  36.67 
 
 
304 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  33.73 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  40.91 
 
 
310 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  36.94 
 
 
316 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  34.94 
 
 
502 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3247  hypothetical protein  30.39 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  34.21 
 
 
352 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>