23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50630  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0354656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4314  hypothetical protein  96.83 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1452  membrane protein-like protein  53.95 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1153  lipoprotein  47.91 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0150107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4113  lipoprotein, putative  45.37 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0777387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3850  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4281  lipoprotein  48.78 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1170  membrane protein-like protein  48.54 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196222  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1237  putative lipoprotein  45.91 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1135  hypothetical protein  46.83 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0564032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19590  hypothetical protein  48.17 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.376572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0278  hypothetical protein  25.41 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2387  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1709  hypothetical protein  40.43 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002118  predicted membrane protein  23.41 
 
 		 516 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0572  membrane protein-like  34.44 
 
 		 158 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.37 
 
 		 325 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0497  membrane protein-like  30.69 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.74 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.67 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1052  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4755  hypothetical protein  31.18 
 
 		 144 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0874822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>