32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  82.78 
 
 		 600 aa  917    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  100 
 
 		 600 aa  1200    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  52.85 
 
 		 614 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  52.85 
 
 		 615 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  50.41 
 
 		 610 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  50.24 
 
 		 610 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  39.55 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  36.48 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  35.29 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2907  hypothetical protein  31.48 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  30.05 
 
 		 643 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  24.22 
 
 		 891 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  23.51 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  25.09 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  25.06 
 
 		 998 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  23.54 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  26.28 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  26.16 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  26.28 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  23.16 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  26.64 
 
 		 964 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  25 
 
 		 977 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  22.06 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  24.75 
 
 		 481 aa  57  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  20.39 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  23.33 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  24.83 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  24.58 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  32.99 
 
 		 504 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2112  hypothetical protein  24.9 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  23.68 
 
 		 517 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  26.34 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>