39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0066 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  982    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  42.95 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  36.58 
 
 		 547 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  37.41 
 
 		 603 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  37.41 
 
 		 603 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  39.8 
 
 		 630 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  37.36 
 
 		 703 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  35.68 
 
 		 580 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  30.62 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  30.26 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  29.58 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  27.81 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  27.42 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  24.05 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  25.1 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  26.2 
 
 		 542 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  27.05 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  29.03 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0297  hypothetical protein  24.39 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2647  hypothetical protein  27.85 
 
 		 437 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0089  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  20.04 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 768 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6079  ABC-type uncharacterized transport system  27.4 
 
 		 674 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  21.79 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  25.56 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  26.33 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  21.95 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  24.56 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  25.63 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  25.35 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  24.82 
 
 		 600 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  24.79 
 
 		 748 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  25.8 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  24.64 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  23.4 
 
 		 557 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  28.77 
 
 		 729 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  23.93 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  22.36 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>