29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2708 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  962    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000297424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0297  hypothetical protein  33.68 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  29.1 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  27.96 
 
 		 498 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  28.51 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  23.66 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0583  hypothetical protein  21.57 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4389  hypothetical protein  23.75 
 
 		 703 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0446435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4232  hypothetical protein  23.68 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1048  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  23.32 
 
 		 603 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.110621  unclonable  0.00000000484608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1019  hypothetical protein  23.32 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2646  hypothetical protein  19.53 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2807  hypothetical protein  25 
 
 		 580 aa  76.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0625078  normal  0.688312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  22.8 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0684  hypothetical protein  21.63 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.589996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2427  ABC-type uncharacterized transporter  24.62 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3076  hypothetical protein  22.18 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2647  hypothetical protein  21.37 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0066  hypothetical protein  21.43 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.656043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4025  hypothetical protein  25.77 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0991  hypothetical protein  23.81 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0089  hypothetical protein  23.94 
 
 		 498 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.927452  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 768 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  21.03 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  24.48 
 
 		 550 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.72 
 
 		 767 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0232  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  22.22 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.66 
 
 		 748 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  22.87 
 
 		 770 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>