21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2994 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  100 
 
 
405 aa  826    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  24.91 
 
 
814 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  25.73 
 
 
934 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25 
 
 
1066 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  23.53 
 
 
255 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  23.27 
 
 
477 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  26.94 
 
 
284 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  24.32 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  24.03 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  26.03 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  24.59 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  23.46 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  24.59 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  41.18 
 
 
753 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  23.17 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  42.11 
 
 
688 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50321  predicted protein  26.37 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  22.87 
 
 
307 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  25 
 
 
272 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  32.2 
 
 
640 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  24.47 
 
 
224 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>