40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2384 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2384  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0332623  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  30.69 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  32.32 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  30.69 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  27.64 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.52 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  34 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  30.85 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  28.12 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  26.42 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  27.03 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  29.84 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  28.23 
 
 		 152 aa  42  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35158  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860566  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  29.84 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  29.84 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  30.21 
 
 		 156 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  27.55 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  27.37 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.53 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  27.96 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 150 aa  40  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>