71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2381 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2381  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  340  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279399  normal  0.781937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3947  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3992  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361661  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3883  YiaL  38.89 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4054  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60662  normal  0.509772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03428  hypothetical protein  39.77 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0138  hypothetical protein  39.77 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03379  hypothetical protein  39.77 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4189  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3899  hypothetical protein  39.77 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4073  hypothetical protein  39.77 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3867  YiaL  38.89 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3780  hypothetical protein  39.77 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0300  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280318  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0251  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0134  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3934  hypothetical protein  41.11 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4126  hypothetical protein  33.64 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0414  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3716  hypothetical protein  34.92 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3541  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205481  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3353  hypothetical protein  37.04 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0479  hypothetical protein  34.86 
 
 
154 aa  61.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0455  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.210812  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3885  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1197  hypothetical protein  34.68 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0441  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0429  hypothetical protein  34.13 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0546  hypothetical protein  32.41 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3693  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.757181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3890  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0569  hypothetical protein  31.53 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3560  hypothetical protein  34.44 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1971  hypothetical protein  33.61 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2157  hypothetical protein  29.69 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.443534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0516  hypothetical protein  32.11 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4077  hypothetical protein  32.35 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5192  hypothetical protein  30.89 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4091  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0950  hypothetical protein  31.93 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.757542  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0503  hypothetical protein  32.32 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1574  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1802  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.149965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1468  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1492  hypothetical protein  28.67 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2429  hypothetical protein  31.78 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0177  hypothetical protein  25.51 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0942  hypothetical protein  24.22 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0180  hypothetical protein  25.51 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0893  hypothetical protein  29.55 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0251499  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3242  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3422  putative mannitol dehydrogenase  27.27 
 
 
164 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3318  putative mannitol dehydrogenase  27.27 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.713407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3326  putative mannitol dehydrogenase  27.27 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.646058  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2772  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1405  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0453  hypothetical protein  23.78 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1296  hypothetical protein  29.29 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3761  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0037  hypothetical protein  22.14 
 
 
147 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5773  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0938  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4507  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0631988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4823  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4732  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.750065  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4753  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4833  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04082  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04118  hypothetical protein  26.44 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0643  hypothetical protein  26.53 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0956559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3182  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>