21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0583 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0583  TonB family protein  100 
 
 		 129 aa  249  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  58 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  46.77 
 
 		 390 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1012  hypothetical protein  30.12 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.9 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  41.67 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  28.3 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  27.71 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  29.76 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  38.1 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  27.68 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  33.78 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  40 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  37.93 
 
 		 212 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  31.51 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.26 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  32.69 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  36.73 
 
 		 458 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  33.33 
 
 		 249 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  37.14 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  36.51 
 
 		 233 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>