More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0414 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  622  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  35.02 
 
 
266 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  34.81 
 
 
265 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.65 
 
 
263 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.69 
 
 
276 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  33.86 
 
 
264 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  34.27 
 
 
275 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  33.64 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  32.63 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  34.26 
 
 
294 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  31.75 
 
 
293 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  29.52 
 
 
266 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  45.32 
 
 
856 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.27 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.45 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  31.54 
 
 
262 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  29.69 
 
 
271 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  30.77 
 
 
280 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  30.48 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.03 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.99 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  29.24 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  30.87 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  32.19 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  28.57 
 
 
262 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  28.33 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.25 
 
 
261 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  28.33 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  29.73 
 
 
262 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  28.28 
 
 
262 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  28.28 
 
 
262 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.41 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  28.28 
 
 
262 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  30.43 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.2 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  30.07 
 
 
260 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  27.95 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  27.95 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.35 
 
 
262 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.23 
 
 
261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.76 
 
 
263 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.74 
 
 
260 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.74 
 
 
260 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.05 
 
 
263 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.54 
 
 
262 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 
261 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 
261 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  30.69 
 
 
261 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  30.67 
 
 
261 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.9 
 
 
260 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.21 
 
 
267 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  26.58 
 
 
262 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.93 
 
 
262 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  28.93 
 
 
262 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  27.53 
 
 
262 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  26.11 
 
 
260 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  28.81 
 
 
260 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  28.81 
 
 
260 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  27.88 
 
 
259 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.1 
 
 
260 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.33 
 
 
266 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  27.22 
 
 
262 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.33 
 
 
266 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  45.45 
 
 
398 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  28.43 
 
 
260 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  27.24 
 
 
261 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  28.76 
 
 
261 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  26.92 
 
 
261 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.66 
 
 
397 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  31.38 
 
 
264 aa  102  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  27.24 
 
 
261 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  28.53 
 
 
264 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  26.1 
 
 
266 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.62 
 
 
266 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  26.03 
 
 
404 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.9 
 
 
260 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.11 
 
 
423 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.77 
 
 
261 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  28.62 
 
 
261 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.77 
 
 
261 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  27.53 
 
 
262 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  29.67 
 
 
263 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  29.67 
 
 
263 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  29.67 
 
 
263 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  27.88 
 
 
261 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  26.96 
 
 
260 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  26.43 
 
 
260 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  26.92 
 
 
261 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.2 
 
 
260 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.2 
 
 
260 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  28.08 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  29.73 
 
 
260 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  29.39 
 
 
260 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>