39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2215 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  40.35 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.36 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.57 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.82 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.25 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.33 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  28.19 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.71 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  30.14 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  30.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  30.56 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  30.63 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  28.57 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  28.91 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  29.36 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  28.7 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5443  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 369 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  28.32 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  26.55 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  27.78 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  24.6 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  31.96 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  27.91 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1622  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 		 374 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 383 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 364 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 		 367 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 372 aa  45.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 396 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  27.96 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0704  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.64 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  29.57 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  28.07 
 
 		 162 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>