60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1288 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  33.01 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  48.86 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  34.95 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  47.56 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  34.95 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  35.24 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  36.26 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  35.44 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  35.16 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.53 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  33.68 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  29.79 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  37.66 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  31.03 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  33.33 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  34.29 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 
86 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 
86 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  30.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  30.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  30.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  30.51 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  30.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  30.59 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  28.75 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  25.58 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  31.87 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  33.87 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  25.58 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  31.71 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  27.06 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  27.91 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  27.96 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  31.11 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  30.84 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  28.7 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  36.76 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  27.47 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  30.11 
 
 
103 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>