More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0467 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  51.45 
 
 
670 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  64.69 
 
 
652 aa  887    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  64.69 
 
 
652 aa  887    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
653 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  64.58 
 
 
644 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  63.61 
 
 
662 aa  864    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  65.77 
 
 
645 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  61.82 
 
 
648 aa  833    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  69.79 
 
 
651 aa  976    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 
650 aa  891    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  66.82 
 
 
651 aa  908    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
653 aa  902    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  57 
 
 
652 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  56.68 
 
 
652 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07740  acetate--CoA ligase, putative  53.9 
 
 
680 aa  656    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.534841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 
651 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  55.97 
 
 
653 aa  754    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  70.26 
 
 
649 aa  956    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  64.74 
 
 
644 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.5 
 
 
658 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0624  acetyl-CoA synthetase  56.77 
 
 
651 aa  775    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0391564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.56 
 
 
655 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
652 aa  1349    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
657 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  65.53 
 
 
651 aa  900    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  51.78 
 
 
657 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  66.04 
 
 
651 aa  903    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  64.51 
 
 
645 aa  866    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  68.52 
 
 
653 aa  923    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3006  acetate--CoA ligase  60.03 
 
 
652 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0231172  normal  0.972893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 
667 aa  658    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  52.56 
 
 
673 aa  666    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 
666 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 
657 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  59.58 
 
 
661 aa  771    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
653 aa  680    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  68.67 
 
 
653 aa  931    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.93 
 
 
660 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.42 
 
 
656 aa  695    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  72.11 
 
 
646 aa  959    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  63.91 
 
 
652 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  82.72 
 
 
650 aa  1137    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  63.71 
 
 
652 aa  901    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  82.97 
 
 
652 aa  1146    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  68.17 
 
 
649 aa  948    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  65.09 
 
 
645 aa  866    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  66.56 
 
 
645 aa  894    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  81.92 
 
 
647 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 
654 aa  677    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.93 
 
 
658 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  64.75 
 
 
651 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.76 
 
 
658 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  65.02 
 
 
651 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  67.35 
 
 
645 aa  903    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  83.1 
 
 
650 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  66.93 
 
 
649 aa  934    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  95.55 
 
 
652 aa  1305    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  56.12 
 
 
655 aa  772    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  63.73 
 
 
650 aa  881    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.48 
 
 
652 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 
655 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  67.49 
 
 
652 aa  880    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  64.26 
 
 
654 aa  859    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  64.04 
 
 
650 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  54.49 
 
 
649 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  53.71 
 
 
644 aa  700    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.18 
 
 
644 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  63.21 
 
 
646 aa  861    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  72.81 
 
 
654 aa  998    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 
631 aa  695    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 
655 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 
650 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 
650 aa  892    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  67.28 
 
 
645 aa  921    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  64.19 
 
 
650 aa  886    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  66.77 
 
 
651 aa  907    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  64.09 
 
 
649 aa  892    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  53.75 
 
 
636 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  64.6 
 
 
651 aa  894    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  67.03 
 
 
645 aa  902    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.69 
 
 
660 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  73.9 
 
 
644 aa  999    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  69.1 
 
 
650 aa  955    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  68.17 
 
 
645 aa  937    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  66.05 
 
 
644 aa  892    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 
650 aa  893    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  64.04 
 
 
650 aa  891    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.1 
 
 
667 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  67.51 
 
 
651 aa  882    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  67.51 
 
 
651 aa  882    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  53.98 
 
 
660 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  68.52 
 
 
653 aa  923    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  63.27 
 
 
650 aa  892    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  64.44 
 
 
653 aa  890    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  63.57 
 
 
649 aa  877    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  69.79 
 
 
651 aa  978    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  69.66 
 
 
649 aa  962    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  57.12 
 
 
661 aa  739    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  54.37 
 
 
660 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  51.24 
 
 
656 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>