More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2673 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  59.89 
 
 
349 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3360  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.69 
 
 
338 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.4 
 
 
340 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2284  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.92 
 
 
338 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  56.41 
 
 
351 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2100  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.6 
 
 
340 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2717  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.84 
 
 
341 aa  360  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2318  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.57 
 
 
338 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263931  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.78 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.69 
 
 
338 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1970  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.25 
 
 
341 aa  354  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.03 
 
 
349 aa  348  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.862427  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1473  alcohol dehydrogenase  53.37 
 
 
340 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0185  alcohol dehydrogenase  53.24 
 
 
340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0624  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  53.41 
 
 
338 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0477  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
351 aa  330  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  51.62 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.46 
 
 
345 aa  325  6e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04280  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  53.39 
 
 
340 aa  325  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20300  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  52.35 
 
 
340 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1032  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.98 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  50.15 
 
 
347 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1854  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.16 
 
 
348 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0215  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.89 
 
 
346 aa  309  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0696766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3625  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  49.41 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698872  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.96 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 
351 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1641  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  50.15 
 
 
326 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2438  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.43 
 
 
347 aa  296  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.931486  hitchhiker  0.00356491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0265  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.94 
 
 
345 aa  295  7e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3749  alcohol dehydrogenase  51.01 
 
 
345 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4121  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.01 
 
 
345 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.991808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0184  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0949  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  46.36 
 
 
345 aa  279  4e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.63 
 
 
393 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.99 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.42 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  37.14 
 
 
345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
389 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
422 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2296  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.93 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  37.76 
 
 
384 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
410 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.12 
 
 
376 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
388 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
387 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.59 
 
 
410 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36 
 
 
346 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2838  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.76 
 
 
377 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.86 
 
 
346 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
346 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.16 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
346 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2881  alcohol dehydrogenase, glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.5 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3025  putative alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36660  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.82 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000975221  normal  0.705006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.32 
 
 
405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3148  putative alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
415 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3114  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.5 
 
 
377 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
400 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24840  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.51 
 
 
444 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3145  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.5 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.52 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3155  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.5 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633298  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
399 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.38 
 
 
386 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.12 
 
 
401 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3669  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
386 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.949441  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.13 
 
 
377 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.770168  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
347 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3133  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.23 
 
 
377 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
344 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  33.16 
 
 
394 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.55 
 
 
400 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2912  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.23 
 
 
377 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.549195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3131  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
377 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6027  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
401 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
346 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1392  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.85 
 
 
401 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6437  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
401 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.632433  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.19 
 
 
351 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.55 
 
 
411 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.19 
 
 
347 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1474  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.47 
 
 
380 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.228942  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.4 
 
 
392 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
388 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5660  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
401 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.02 
 
 
401 aa  169  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  33.81 
 
 
346 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
393 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.14 
 
 
389 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.28 
 
 
389 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.81 
 
 
392 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
400 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
360 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0344  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.68 
 
 
396 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>