62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1213 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 81 aa  166  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  76.27 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  60.81 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  61.33 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  60.81 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  62.32 
 
 		 76 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  70.49 
 
 		 71 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  57.33 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  68.85 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  58.75 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  62.9 
 
 		 76 aa  87.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  60.94 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  55.38 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  65.52 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  61.82 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  51.35 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  54.39 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  51.72 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  44.23 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  36.84 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  38.89 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  35.09 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  44.9 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  37.04 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  40 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.04 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  37.25 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  38 
 
 		 315 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  38 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  36 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  35.09 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 305 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  37.29 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 371 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>