215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1163 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1163  glycerate kinase  100 
 
 		 359 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  50 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  47.18 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  52.3 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  42.47 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  42.47 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  42.2 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  44.53 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  46.58 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  46.76 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  46.56 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  42.59 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  38.82 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  41.13 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  46.3 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  39.89 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  44.53 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2777  Glycerate kinase  42.82 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  44.14 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  45.79 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  47.68 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  40.16 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  39.58 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.32 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  46.09 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  45.95 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  40.11 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  38.54 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  42.34 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.95 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  40.12 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  46.27 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2071  glycerate kinase  37.06 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000043752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  42.55 
 
 		 392 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  36.12 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  36.12 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  38.81 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  42.05 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.6 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  38.37 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.62 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  42.69 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  37.63 
 
 		 384 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1010  glycerate kinase  45.53 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  42.05 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  38.81 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  46.89 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  39.83 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  39.68 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  39.68 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  39.68 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  39.42 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  40.59 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  40.68 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  41.24 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  40.62 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  39.08 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  43.2 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  43.47 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.46 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  39.22 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  39.95 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  37.74 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  38.5 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  41.33 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  37.04 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  45.65 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  39.26 
 
 		 380 aa  185  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2611  glycerate kinase  38.7 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  44.58 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.08 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  44.58 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  44.58 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  37.47 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  39.36 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  37.77 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1592  glycerate kinase  37.01 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  42.57 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  42.72 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  43.01 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  37.8 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  40.58 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.55 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  37.27 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  42.21 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  37.47 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  43.23 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  38.2 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  42.41 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  42.41 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.95 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  37.33 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  37.2 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  36.56 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  42.11 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  42.11 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  40.7 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>