216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1592 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1592  glycerate kinase  100 
 
 		 391 aa  794    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0208  glycerate kinase  58.12 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00158746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2611  glycerate kinase  52.55 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  43.88 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  43.28 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  44.02 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  44.29 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  43.21 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  44.63 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  44.29 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.54 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  44.02 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  44.02 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  44.02 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  45.48 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  40.86 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  42.39 
 
 		 381 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  40.86 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  43.01 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  43.75 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  42.11 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  41.71 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  44.33 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  39.13 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  44.31 
 
 		 381 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  42.33 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  44.31 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  41.03 
 
 		 387 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  44.31 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  44.31 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  44.31 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  44.31 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.78 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  44.02 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.78 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  44.31 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  42.97 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1859  glycerate kinase family protein  43.27 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  40.53 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.52 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  44.02 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.49 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  41.94 
 
 		 376 aa  269  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.76 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  42.39 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  41.03 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  41.21 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  39.68 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  38.48 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  43.02 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  40.74 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  38.27 
 
 		 380 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  39.67 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  40.27 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  40.27 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  40.69 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.13 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  39.41 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  39.41 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.4 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  40.91 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  37.8 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.13 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  40.74 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  39.41 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  39.41 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  39.04 
 
 		 378 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  38.72 
 
 		 383 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  39.52 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  39.25 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  38.86 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  38.86 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  39.25 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  40.75 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  41.02 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  39.25 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  38.6 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.11 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  39.67 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.11 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  37.9 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  39.67 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  38.93 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  40.52 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  40.52 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  39.02 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  40.52 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  38.59 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  40.23 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  38.08 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  41.02 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  38.17 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  38.08 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  38.08 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  40.23 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  39.89 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  39.13 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  36.73 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  40.23 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  40.69 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>