156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1073 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.84 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  67.8 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  73.68 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  70.49 
 
 
66 aa  84.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  74.14 
 
 
70 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  63.77 
 
 
72 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  71.19 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  67.14 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.12 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.08 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  74.07 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  68.52 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  76 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  68.85 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  74.51 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  67.92 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  65.52 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.08 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  75 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.8 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60.94 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60.32 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  72.73 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.35 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.97 
 
 
81 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.73 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.55 
 
 
70 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.05 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.46 
 
 
69 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.56 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.14 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.76 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.88 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.69 
 
 
83 aa  52  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.21 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.08 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.62 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.79 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
83 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48 
 
 
86 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.62 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.16 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.71 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.67 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  44 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.54 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.31 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.43 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  41.43 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.72 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
97 aa  43.5  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.48 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>